RELATED Live
- Разработка нового метода идентификации бактерий с использованием технологии нанопор-секвенирования
- Превосходные характеристики и короткий срок исследования по сравнению с существующим методом лабораторного культивирования
Слева-направо: профессор Мун Чанг Соб (Moon, Jangsup), профессор И Донг Ён (Lee, Dong Yeon), профессор Чу Гон (Chu, Kon )
Процесс кровообращения у больных сахарным диабетом с высоким уровнем глюкозы нарушен из-за высокой вязкости крови. В частности, большому риску из-за сильных нагрузок подвержены ступни, расположенные далеко от сердца.
Синдром диабетической стопы определяется в виде язвы или деструкции глубоких тканей, связанной с неврологическими нарушениями (периферической невропатией). Инфекция может развиться быстро и в тяжелых случаях может привести к ампутации конечности.
Команда профессоров Больницы Сеульского Национального Университета в лице профессора Мун Чанг Соб (Moon, Jangsup), профессора И Донг Ён (Lee, Dong Yeon) и профессора Чу Гон (Chu, Kon ) 7-го числа сообщила о том, что теперь стало возможным с точностью идентифицировать бактерии-возбудители инфекции диабетической стопы с помощью новейшей технологии нанопор-секвенирования, представляющей из себя современный аналитический метод базовой последовательности.
Результаты эксперимента с образцами ткани пациентов показали, что данный метод обладает лучшими аналитическими характеристиками и более высокой скоростью по сравнению с существующим методом лабораторного культивирования.
Исследовательская группа сравнила эффективность нового метода с существующим методом лабораторного культивирования, используя 54 образца некротической ткани, взятых во время операции у пациентов с инфекцией диабетической стопы. Новый метод секвенирования позволил выявить еще больше мультибактериальных инфекций. Мультибактериальная инфекция была выявлена приблизительно в 81% (44/54 образцов) случаев, однако в результате существующего метода лабораторного культивирования инфекция была выявлена лишь в 51% (32/54) случаев. 12 мультибактериальных инфекций были неправильно идентифицированы в качестве монобактериальных инфекций (10 ед.), либо не были идентифицированы вовсе (2 ед.).
Рис. 1. Сравнение результатов исследования с помощью недавно разработанного метода секвенирования 16S (слева) и
существующего метода лабораторного культивирования (справа).
* ■ Мультибактериальные инфекции ■ Монобактериальные инфекции ■ Не идентифицировано
Кроме того, метод позволил определить, каких бактерий больше в мультибактериальной инфекции и дать относительную количественную оценку каждому виду бактерий. Согласно анализу, бактерии, которые были выявлены в большом количестве с помощью технологии секвенирования, в большинстве случаев не были идентифицированы методом существующего лабораторного культивирования. Кроме того, было отмечено немало случаев, когда бактерии, идентифицированные методом лабораторного культивирования, присутствовали в пораженных участках в очень малом количестве.
Кроме того, существующий метод лабораторного культивирования не позволял выявить часть таких анаэробных бактерий, как превотеллы и бактероиды, а новый метод секвенирования продемонстрировал высокую чувствительность и позволил выявить данные бактерии.
Другими словами, данный метод исследования подтвердил тот факт, что существующий процесс поиска бактерий-возбудителей инфекции диабетической стопы, основанный на методе лабораторного культивирования, не может полностью отразить фактический состав бактерий.
Скорость анализа также оказалась намного выше по сравнению с существующим методом лабораторного культивирования. Процесс культивации бактерий с помощью существующего метода лабораторного культивирования занимает в среднем от 2-3 дней до 1 недели, а новый метод анализа с помощью секвенирования позволяет подтвердить наличие большинства бактерий-возбудителей в течение одного дня.
Благодаря этому исследованию стало возможным на шаг приблизиться к точной диагностике и лечению бактерий-возбудителей инфекции диабетической стопы.
Профессор Мун Чанг Соб (Moon, Jangsup) отделения клинической геномики поделился, что «данный метод позволит с точностью диагностировать бактерии-возбудители инфекции диабетической стопы с помощью новейшей технологии в области молекулярной генетики и внести вклад в совершенствование прогнозов лечения пациентов». Он добавил, что «данное исследование позволит выявить механизм развития инфекции диабетической стопы, сложно поддающейся лечению и изменить существующую парадигму лечения».
Между тем это исследование было опубликовано в последнем номере Международного научного журнала Диабет (Diabetes).
Запро